醫療輔助隊主要工作是負責增援常規衛生應急服務。隊員來自包括專業醫生、護士及社會各階層等志願人員。成立目的是當香港遇上天災人禍時，能夠號召志願人士聯手應急抗災。本隊服務包括下列兩大類：
(一) 在緊急事故發生時所提供的服務
- 緊急召集服役
本隊如需協助處理意外或災難等事故，會派遣一支應急特遣隊支援在場的醫療隊伍，為傷者提供輔助醫療護理服務。奉召到場所需的標準時間為30至45分鐘。
- 颱風值勤
當八號或更高的風球懸掛後，本隊會調派隊員到消防處通訊中心擔任部門聯絡主任，負責協調各部門作出的拯救行動。此外，本隊會調派隊員到消防處救護站／救護局報到，協助設立急救站，為有需要的市民提供急救服務;並會調派救護車人員到指定的救護站／救護局當值，以支援消防處的救護車服務。
- 救護車服務
本隊位於顯田的新界東總區辦事處駐有一輛救護車，負責為消防處提供支援。每日下午3時至晚上11時，本隊一旦接到消防處的緊急召喚，該救護車便會開赴現場，協助救援。
(二) 其他服務
- 非緊急救護車載送服務
本隊提供非緊急救護車載送服務的時間為每天（包括星期日及公眾假期）上午8時至下午6時。
- 郊野公園急救及救護車服務
本隊逢周日及公眾假期會到郊野公園及單車徑為市民提供急救及救護車服務，服務時間為上午10時至下午4時。急救站設在漁農自然護理署指定的地點。
- 急救服務
本隊會盡量回應非牟利機構的請求，為他們提供急救服務。
- 公務員訓練
本隊除為公務員開辦基本急救課程和復蘇治療課程外，亦會盡量回應其他機構的請求，舉辦收費的急救講座。
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